按照“政府牵头、部委支持、市场运作、多方联动”的工作机制，由顾秉林院士担任论坛主席，许智宏院士、饶子和院士担任论坛联合主席，设立论坛组委会、顾问委员会、学术委员会、腾冲科学家论坛发展基金会、秘书处、论坛中心。

一、论坛组委会

组委会为论坛决策机构，负责论坛重大事项决策，负责向国家部委、指导单位、支持单位报告和协调重大事项。

二、论坛顾问委员会

顾问委员会为论坛咨询指导机构，负责为论坛提供思想智力支撑，成员由组委会聘请。

三、论坛学术委员会

论坛学术委员会为论坛的学术领导机构，由论坛主席、联合主席发起，成员由科技界、教育界、产业界等领域的高层次专家组成，并由论坛发展基金会理事会和组委会共同聘任。负责研究提出每年论坛主题，指导腾冲科学大奖评选工作，分领域设立和不定期发布各类科技创新榜单，评估与发布论坛成果等。

四、组委会办公室

组委会有省科技厅、省科协、省委组织部、省委宣传部、省委网信办、省接待办、省发展改革委、省工业和信息化厅、省教育厅、省公安厅、省财政厅、省人力资源社会保障厅、省自然资源厅、省生态环境厅、省农业农村厅、省商务厅、省文化和旅游厅、省卫生健康委、省外事办公室、省市场监管局、省投资促进局、云南日报报业集团、云南广播电视台、省工商业联合会、保山市人民政府、腾冲市人民政府26个成员单位。

组委会办公室设在省科技厅，统筹论坛筹备工作，协调各方工作落实，不定期向组委会请示有关事项和报告工作进展。办公室下设秘书处，为论坛的常设执行机构，负责统筹、指导、协调论坛日常运转，承担日常工作；负责论坛重要文件和有关制度规范的研究起草，拟订论坛总体方案并组织实施；督促落实组委会议定事项、工作部署和要求；组织开展论坛品牌宣传；完成组委会办公室交办的其他任务。

五、腾冲科学家论坛发展基金会

腾冲科学家论坛发展基金会是由热心公益事业的自然人、法人及其他社会组织自愿参加的以从事公益事业为目的的非营利性社会组织。负责论坛资金筹措和管理；资助组织开展以“科技引领未来”为主旨的有关学术报告、讲坛、论坛和其他科技活动；资助开展国内外科技合作、考察交流等活动。

六、论坛中心

论坛中心是不以营利为目的的社会组织，在秘书处领导下开展工作。负责具体落实论坛组委会工作部署要求及秘书处的有关工作安排；协调对接国内外资源，做好论坛的市场化运作；负责论坛日常运营管理和做好论坛主题策划、会务组织、活动筹备、品牌宣传、商业运营等工作。

七、腾冲专班

做好论坛筹备及会务、接待等服务保障工作；负责起草论坛有关文稿材料；负责参会嘉宾信息的收集、汇总工作；负责论坛资料的收集、整理和归档；负责月度讲坛、季度论坛的组织实施；完成组委会和组委会办公室交办的其他工作。

八、年度论坛工作组

设立综合协调组、规划建设组、会务组、宣传组、人才及项目引进协调组、接待组、外事组、安全保障组、疫情防控及医疗保障组等有关工作组，具体负责落实论坛各项筹备工作。